Při čištění by se měly používat speciální čisticí prostředky a měkký hadřík k jemnému otření otvorů v sítu aniloxového válce, aby se zabránilo poškození jeho jemné struktury tvrdými předměty. Odstranění prachu z povrchu těla stroje, vodicích lišt a otvorů pro odvod tepla servomotorů je také zásadní pro zajištění plynulého odvodu tepla a stabilního mechanického pohybu. Údržba mazání musí striktně dodržovat specifikace zařízení a pravidelně doplňovat specifikované mazivo do vodicích lišt, ložisek a dalších součástí, aby se snížily ztráty třením a udržela se dlouhodobá přesnost flexografického tiskového stroje. Kromě toho mohou denní kontroly těsnění pneumatických potrubí a hromadění prachu v elektrických skříních účinně zabránit náhlým poruchám.

Stabilita systému flexografického tiskového stroje závisí na dvojí údržbě hardwaru a softwaru. Přestože bezpřevodová převodová konstrukce zjednodušuje mechanickou složitost, je stále nutné pravidelně kontrolovat těsnost servomotoru a napnutí synchronního řemene, aby se zabránilo uvolnění a odchylkám v registru. Z hlediska řídicího systému je nutné monitorovat parametry servopohonu v reálném čase a kalibrovat registrační systém. Citlivost snímače napětí a vakuového adsorpčního zařízení přímo ovlivňuje přenos materiálu, a proto je nezbytné denní čištění a funkční testování. Při dlouhodobém používání je stejně důležitá správa spotřebního materiálu flexografické tiskárny, jako je včasná výměna škrabek a stárnoucích inkoustových trubic a pravidelné zálohování parametrů zařízení pro řešení anomálií dat. Regulace teploty a vlhkosti v dílně může snížit deformaci materiálu a elektrostatické rušení a dále optimalizovat tiskový efekt. Pouze prostřednictvím vědeckých a systematických strategií údržby mohou flexografické tiskové stroje i nadále využívat své výhody vysoké přesnosti a vysoké účinnosti a zároveň udržovat úsilí o usnadnění strukturální optimalizace a technologického pokroku v ekosystému tisku a balení.